Heyrovský urodził się w 1890 roku w Pradze jako syn profesora prawa. Studiował chemię, fizykę i matematykę na Uniwersytecie Karola, a następnie na UCL pod kierunkiem Ramsaya Donnana. Uzyskał tytuł licencjata w 1913 roku, doktora w 1918 roku oraz doktora nauk ścisłych w 1921 roku. Podczas I wojny światowej pracował w szpitalu jako chemik i radiolog. W 1922 r. wynalazł polarografię, rozwijając tę gałąź elektrochemii. W 1926 r. został pierwszym profesorem chemii fizycznej w Pradze. Założył czeską szkołę polarograficzną i kierował badaniami. W 1950 r. kierował Instytutem Polarograficznym, który w 1952 r. został włączony do Akademii Nauk. Ożenił się w 1926 r., miał córkę Jitkę i syna Michaela. Zmarł w 1967 r. w wieku 76 lat, pochowany w Pradze. Otrzymał Nagrodę Państwową w 1951 r. i Order Republiki w 1955 r. W 1965 r. został wybrany członkiem zagranicznym Królewskiego Towarzystwa Naukowego. Otrzymał tytuły doktora honoris causa wielu uniwersytetów. Był członkiem honorowym licznych akademii i towarzystw na całym świecie. Wykładał polarografię w USA, ZSRR, Anglii, Szwecji, Chinach i Egipcie. Krater księżycowy nazwany został Heyrovský.